J-OCTA：SIESTA耦合计算

案例简介：分子动力学J-Octa 和第一性原理软件Siesta 耦合计算仿真。

目的和方法

下面是一条能量曲线，显示了使用J-Octa的新特性“Siesta界面能量工具”获得的铜和烷烃分子相互作用的能量曲线。图中的平方点表示由Siesta（DFT）估计的能量曲线，实线表示由识别的LJ电位得到的结果。各种分子种类，丙烷、丁烷、戊烷和己烷使用相同的LJ电位参数。DFT计算结果的趋势得到了很好的体现。

利用获得的LJ电位，用户可以对界面系统进行MD模拟，如下所示。这有助于理解界面现象和新材料设计的发展。

当计算具有如此大表面积的平板模型时，需要制备100多个原子，并且通常需要大量的计算时间。通过使用SIESTA，您甚至可以在典型的工作站上执行高速计算。

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