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SIESTA Pro:第一性原理计算软件
ASAP(Advanced Simulations Atomistic Platform)是Simune公司开发的一个高级原子模拟平台。ASAP由一组围绕SIESTA代码开发的工具和模块组成,以便于工业用户使用。ASAP还旨在通过将代码与其他功能结合在一起或以与SIESTA不同的规模工作来扩展SIESTA功能。

ASAP​工作流(Asap Workflow)

ASAP工作流程自动化所需的任务和步骤,以便轻松执行SIESTA计算。


ASAP fdf生成器(fdf Builder) 

ASAP fdf生成器自动化准备fdf SIESTA输入文件所需的任务。


目前,SIESTA用户必须:


  • 知道控制SIESTA时使用的近似值的关键字;
  • 优化定义SIESTA计算的特定参数;
  • 手动创建一个无错误的输入文件。无错误输入文件是用户的责任。SIESTA只做最少的检查(例如“原子太近”)。


ASAP fdf生成器包含各种工具,旨在帮助准备(fdf编辑器和Smarter fdf)和验证(fdf编辑器)SIESTA输入文件。它还包含一组自动优化SIESTA输入参数的脚本(Convergence 工具)。


在ASAP中实现的工具的示意图——fdf生成器:


                  • fdf编辑器(fdf Editor)——它有助于选择控制SIESTA中实现的近似值的变量。图形用户界面提供了两个复杂度级别(基本和高级),具有不同数量的已实现输入参数。图形用户界面与输入文件的手动版本共存。
  • 智能fdf(Smart fdf)——它的设计是为了满足特定的用户需求(计算的精度水平、系统和感兴趣的材料特性)。
  • 收敛工具集(Convergence Tools)——该工具的设计符合可用性、效率和简单性的特点。


ASAP fdf生成器在准备SIESTA 输入文件时减少了投入的时间并避免了常见的人为错误。

ASAP结构生成器(Structure Builder) 

ASAP 结构生成器:模块设计用于轻松构建和操作系统结构。


SIESTA输入文件必须包含系统的物理数据:元素类型、种数和原子位置。


ASAP结构生成器有助于表面和分子的构造及其操作。它将减少准备SIESTA输入文件的投入用户时间,以便在任何领域(包括化学和汽车行业)进行感兴趣的模拟。


你可以建造:


  • 分子
  • 对称晶体
  • 按Wyckoff位置排列的晶体*
  • STM提示*
  • 纳米颗粒构建器(Wulff-构造)*


操纵:


  • 劈裂面
  • 分子耦合(对接)*


* 正在开发的功能


ASAP建造的结构示例(tructure builder)包括:


a)四原子层厚金属板(侧视图)

b)磷(2×2)单元间(顶视图)。


ASAP数据(Data) 

数据库导入相关信息以馈送SIESTA输入文件。


ASAP 数据显著减少投入的用户时间。


合并数据库可分为两大类:


  • 内部数据库。它包含由Simune生成和更新的数据,这些数据包括:
赝势法
原子轨道基集

​stm tips基础集*


  • ​外部数据库(来自外部方的数据):
结构几何(普通分子和晶体结构)*
弹性对称*

常见晶体结构的高对称k点*


* 正在开发的功能



ASAP服务器(Server) 

此模块有助于将SIESTA 计算从GUI提交到本地计算机以及超级计算机:


  • 将计算从尽快发送到服务器;
  • 将结果从服务器传输到ASAP。


ASAP服务器将适应这两种情况。

ASAP分析工具(Analysis Tool) 

ASAP分析工具自动化从SIESTA 输出文件分析和可视化电子材料特性所需的后处理任务。


ASAP提供一套分析工具:


  1. 能量(力)收敛
  2. 带结构(& fatbands)
  3. 分子轨道:HOMO和LUMO
  4. 万尼尔函数(Wannier functions)
  5. 电荷密度
  6. 状态密度(总量和预测)
  7. 晶体轨道重叠群(COOP)和晶体轨道哈密顿族(COHP)
  8. 局部状态密度


ASAP​插件(Asap Plugins)

ASAP插件设计用于执行特定任务。每个插件都可以最大限度地减少用户的工作量,并将其从几何结构的定义引导到最终的结果分析。